针对事业部中被诟病的诸多问题，部分先行实施事业部改革的基金公司也在对这一机制进行优化，优秀的事业部合伙人被提升为股权合伙人，增设关键绩效指标考核（KPI），避免“只讲收入，不讲业绩”等，事业部制度2.0版本逐渐形成。
前海开源基金表示，公司在不断优化事业部制度，从单纯的事业部模式，逐步进化为股权合伙人、事业合伙人、事业部制度相结合，优势互补的动态调解模式。
除了事业部制外，前海开源基金还推出了事业合伙人激励计划，让一些优秀的员工和业务骨干参与到公司的分配之中，共享公司发展红利。
长期来看，优秀的事业合伙人可以发展成为股权合伙人，股权合伙人因实际出资而享受股权投资收益。股权合伙、事业合伙、事业部制是构成推动公司长期可持续发展的三大激励机制，自2018年开始执行，目前已有效开展。
前海开源基金称，相关事业部制度一直在改革与优化，目的是提倡长期激励，有效地促进团队共同奋进。目前事业部分为销售事业部和投资事业部，事业部的激励制度不仅要提升效率，也要兼顾投资事业部与市场事业部之间、投资事业部内部权益投资与其他性质投资之间、市场事业部内部不同销售方式之间的分配均衡。通过制度的改革优化，有效推动了不同事业部之间的协同合作，不断提升合作效率。
融通基金则在事业部简单提成的基础上，增设KPI考核制度。据融通基金介绍，2014年，融通基金在行业内率先推出协同事业部制,公司设置6个事业部：权益事业部、固定收益事业部、国际事业部、零售事业部、机构事业部和互联网事业部，目的是实现前中后台协同作战。与其他基金公司事业部制不同的是，融通基金事业部的KPI考核，事业部获得业绩提成需要完成KPI考核，经过KPI修正，这样做，避免了事业部制急功近利，不再是“只讲收入、不讲业绩”。
在具体操作上，融通基金每年会针对不同事业部设计不同的KPI考核，投研事业部70%的考核落在投资业绩上，市场事业部的KPI更多则是放在规模增量上，而固收事业部还可能设置不能出风险事件的考核等。为此，融通基金专门上线了人力资源管理系统进行事业部核算，使得考核管理更清晰，收入和成本的划分更明确，让员工能够清楚看到自己的考核绩效报表，了解自己每一项工作的考核结果以及薪酬来源。
中欧基金强调股权改制是事业部改革的有利保证，股权改制和事业部改革只是一系列制度建设中的两个重要环节，而制度设计的系统化才是中欧基金改革成功的保障。
在改革最初的几年，中欧基金系统化的制度设计包括五个方面，分别是所有权改革、治理结构完善、激励机制改革、推进扁平化的架构，以及合伙人文化建设。
在系统化的改革中，中欧首先着力于股权改制。通过股权结构的改造，管理层成为股东，核心员工持有公司股权，这便理顺了股东、管理层和员工之间的利益关系，也实现了利益的一致性。股权是公司治理的基础，只有建立在合理股权结构上的治理才是有效的。
中欧基金在所有权改革的基础上，进一步推动治理结构的完善，这不仅使管理层在公司的话语权明显提升，而且使公司在决策机制上更加科学合理，并能依靠治理机制来支撑公司的长远发展。
有了股权结构和治理机制的支撑，中欧基金顺利地启动了以事业部为代表的激励机制的改革，并得以长期坚持。这些激励机制的设立有多重目的，并非简单的收益划分，而是要实现股东、员工和投资人长期共赢的局面。
